黄緑色の鼻水が出ます。

はじめまして。アドバイスを頂きたいと思いまして質問させていただきました。
チワワのメスで生後５ヶ月、体重１㎏で避妊はまだしていません。
予防接種３回摂取済み・狂犬病ワクチンは未接種です。

H21年の12月中旬頃から水のような鼻水を出すようになり、そのうちくしゃみと一緒に左鼻から黄緑色の粘り気のある鼻水が１日１～２回でるようになりました。通院したところ細菌性の鼻腔炎と診断され抗生剤を処方してもらい２週間服用ました（検査等はありませんでした）。

薬を服用中は黄緑色の鼻水が出なかったので（透明な水鼻汁はたまにでていました）しばらく薬なしで様子をみることになったのですが、抗生剤をやめて３日経過してから、また黄緑色の鼻水が出るようになりました。

黄緑色の鼻水はいつも１日１～２回、朝と夕方に左鼻から出ます。
いつも鼻が湿っているため、鼻水を吸い込んで逆くしゃみをよく起こしていますし、苦しそうに呼吸しているときもあります。鼻水以外は食欲も旺盛で、元気ですし体温も平熱で体重も順調に増加しています。またせきはなく、歯周病もありません。

今後の治療として、もう一度抗生剤を飲ませた方がいいのでしょうか？病院の先生からは抗生剤は子犬の免疫力を弱くするのであまり使用しない方がよいと聞きました。
また、上記の症状で細菌性以外にどのような病気の可能性があり、どういった検査をすればよいでしょうか？

まだ子犬なので、早く原因を特定して治してあげたいと考えています。
アドバイスをどうぞよろしくお願いいたします。