両方の牙が抜けました。

はじめまして。ご質問させて頂きます。

昨年１１月上旬に右の牙が抜け、１２月に左の牙が抜けました。カリカリを普段どうり食べていますので様子をみていましたが、口元が赤いようなので（口の中を見せてくれません）本日１月５日動物病院を受診しました。「先に抜けた方の歯茎は穴が埋まりつつあります。後に抜けた方はこれから埋まるでしょう。このまま菌が悪戯しないで落ち着いてくれれば大丈夫です。様子を見ましょう。」との事です。
今日は３年振りに３種混合ワクチンの接種をお願いしましたので、抗生剤の注射は止めた方がいいでしょうと言われ、ゲンタシン軟膏をだしていただきました。
今回お聞きしたいのは、牙の根本をそのままにしておいて大丈夫なのでしょうか？家に帰って来てからなにか不安になてきました。
(１日ほとんどベッドの上で横になっていて元気がないように感じます）

アドバイスを頂きたく投稿しました。
お忙しいなか、宜しくお願い致します。