コクシジウム・ケンネルコフ

はじめまして。ちょうど今日で三週間になるフレンチブルドッグのメスです。家に来た日に咳をしていて、なかなか治らないので病院へ連れて行ったところ、きちんと調べてはいないのですが、おそらくケンネルコフだと言われました。そして通院するなか、一応検便しときましょうと言ってくれたので昨日しました。なにもなければいいが。と思っていたら厄介な虫がいる。とのことでした。コクシジウムです。
家にきてからの感染はどちらも可能性が低いと言われました。ペットショップに居る時かブリーダーの所にいるときに感染したのでしょうか？
かかりつけの獣医師さんは知り合いの方なので、ペットショップに言ってみたら？といわれたんですが、このような場合どうすればいいんでしょうか？
仕事もしてますし、コクシジウムをきちんと完治させるにはあまりにも厳しい状況です。仕事中はトイレの世話もできないし。入院するしかないでしょうか？おねがいします。