軟便が止まりません

はじめまして。長文になりますが、相談にのってください。

うちのメスは、去年１０月の上旬に団体に保護され、団体のかたのお宅でお世話をしていただいた子なんですが、１２月ごろ他の保護猫の猫カゼ（おそらくカリシ）がうつってしまい、うちへ来た１月下旬もまだ少し鼻がぐずぐずの状態でした。
来た翌日から便がゆるく、今日に至っています。
病院にもカゼを直すこともあり、来た翌日からずっとかかっています。便のことも検便はそのつど行っています（約２週間に一回の割合）。本人も連れて行ってお尻からも直接調べてもらっています。しかし、一度も寄生虫などは検出されません。
最初は、整腸剤、えさ（ヒルズwd?）などで様子を見ましたが、変化がなく、３月になり、抗生剤（白い錠剤）と整腸剤を２週間与えました。いったん、薬を飲ますとよくなったのですが、薬がなくなって４日目あたりから少しずつ緩みだし、１０日目にはかなり軟便になりました。

時期を同じく（３月中旬）、一緒に飼っているオスの便も同じような軟便になってきました。

オスは９月中旬生まれで、やはり捨てられていた子で、拾っていただいた方から譲り受けました。この子は、異嗜行動があるものの、便はいつもコロンとしたものだったので、メスの細菌がうつったものではないかという診察でした。

２匹ともに同じ抗生剤を２週間飲ませましたが、まったく改善せず、最近のオスの便は、黒いどろどろのものに変わってきました。匂いも粘土というか、コールタールというような感じでしょうか、便特有の匂いはしなくなってます。
オスのほうにだけ、抗生剤の注射（皮下注射と筋肉注射）３日間打ちましたが、注射があわず、２日目あたりから具合がわるくなり、食欲も減ってしまいました。便も硬いものがでるものの、後半の便はどろどろとまったく変わらないものがでました。
２匹ともに便の回数は１日に１回から２回です。

これまでの間、えさが合わないのかと市販の安いもの（オスを譲り受けたときに食べていたもの）から、徐々に市販の高いものにずいぶんと変えましたが、あまり効果は期待できませんでした。アレルギーのことも少し頭にあったので、最近になってソリッドゴールドを与え始めました。

一匹だけならともかく二匹ともとなると、こちらも見るに絶えられません。
費用のほうもかなりかかってきていて、ちょっとつらいです・・・

アレルギー検査に関しても、何度となく聞いてみましたが、１歳を過ぎるとまた結果が違ってくるから、今はまだ小さいので早いといわれました。
これからは、消化器サポートを２匹ともに与えるほかは、治療法が見つからず、中断状態になっています。

実は、去勢手術も控えていたのですが、注射で具合が悪くなり、延期になってしまいました。こちらもあまり延期したくない状態です。

今後はどのような処置が考えられますでしょうか？
アレルギー検査のこともやはりお願いしてみるほうがよいのでしょうか？