犬のピロリ菌について

はじめまして。ご意見を頂きたく質問させていただきました。もうすぐ7歳になる柴犬です。小さいころから比較的よく吐くことがあったのですが、吐いた後はすぐ元気になっていました。（その都度受診はし、だいたいが胃炎と診断されていました）　去年春にいつものような吐き気ではなく、毎朝長時間吐き気が続くようになりなかなか嘔吐できずに苦しみ、ひどい時は半日玄関に座りうなだれていることもあるようになったのでかかりつけの獣医さんに受診しました。
いつもと違う様子から、血液検査や内視鏡、アレルギー検査等何日かかけてしていただいた結果、内臓などのに問題はなく食物アレルギーがいろいろと
あることがわかりました。そしてピロリ菌が異常に多くなっていることもわかりました。そこで吐き気の原因は鶏やお米にアレルギーがあるにもかかわらず日常そのアレルゲンを摂取し続けてきたことにより胃粘膜が荒らされ、そのためピロリ菌が増殖したことにある、と獣医さんから説明がされ2週間程ピロリ菌を抑える薬を処方していただきました。投薬直後は具合の悪さはなくなりましたが、それ以降獣医さんのアドバイスのもとアレルギーとなるものは避けた食事をさせるようにしていても定期的に朝具合が悪くなるような時が１ヶ月に２～３度２～３日あります。気分が悪くうなだれていて、しばらくして治る時もあれば、吐くときもあります。あまり具合が悪そうなときは獣医さんに受診しますが、このごろではピロリ菌の薬を処方されることは少なく、季節的な胃腸炎と診断され消化薬等いただくことが多くなりました。具合が悪いのがいつもピロリ菌と限らないのか、ピロリ菌が原因とすれば徹底的な治療はしなくていいのか心配です。