トリコモナスについて

初めまして。
今年2月産まれのスコティッシュフォールドを、5月から飼っております。
うちに来てすぐから軟便をしていたので調べたところ、トリコモナスの原虫がいました。フラジールや、免疫を上げる薬などを飲み、良くはなるのですが、薬をやめるとまた軟便になってしまい、未だによくなりません。
先日の検査では、持ち込んだ便にも大量に発生しているとの事でした。持ち込んだ便からも見つかることはあまり無いようで、トイレの除菌を徹底するよう言われたのですが、室内飼いの猫ですし、家中走り回っています。菌がアチコチにいるのであれば駆除しきれないなと途方に暮れております。寄生虫は、外の空気にふれることで、死滅はしないものなのでしょうか。
あまりにも繰り返していて、その度にお尻から便をとるので、恐怖症になってしまい、この間は大暴れして看護師さんが血だらけになってしまいました。その為、次回は便だけを持ってくるよう言われたのですが、その便からトリコモナスが見つからなければトイレや家の中の除菌は今程徹底しなくても大丈夫でしょうか。飼い猫は1匹だけで、外には出しておりません。うちに来てから、薬を飲んでいない日の方が少なく可哀想です。アドバイスお願いします。