流産について

初めまして、質問させていただきます。去年の９月の事なのですがMISUTOともう一匹の子（ころん、一回出産経験あり）が妊娠していました。
２匹とも、エコーで見たところ少なくて４頭はいますと言われていました。
MISUTOは妊娠４３日目頃破水したようだったので、すぐ病院に駆け込みました。
その時先生に「何頭かいるうちの一匹の子がどうも袋が破れたみたいだけど」と言われ「どうにかなりませんか？」と聞きましたが「破れたのはどしようもないよ、無理だねえ。でもその子をふくめてみんな元気です」と言われました。でもその５日後くらいに胎盤がはがれたのかドロっとした大きめの透明のゼリーのようなものが出たので直ぐまた病院へ行きました。その後お腹の中で妊娠４８日目で全頭死んでいることを告げられました。その後の処置は点滴、子宮洗浄をし、抗生剤を一週間くらい飲ませました。

ころんは妊娠４１日目で陰部からオロみたいなのが出て病院へ行き、入院させましたが、エコーで見たとき子供の大きさは４．５センチほどと聞きました。その３日後くらいに全部お腹の中で死んでいますと告げられました。このままオロで、子供をどんどん出せば大丈夫とのことで点滴をし、子宮洗浄はしていません。抗生剤は一週間飲ませました。
その時にヘルペス等の可能性もあると思い検査しましたが結果は陰性でした。
何らかの菌が増殖したのではとの先生の診断でしたが、その菌が何なのかは断定できませんでした。
先生からは流産させる菌は２，３種類しかないと聞きました。どちらの子も子宮蓄膿などはありません。妊娠中免疫力が落ちやすい事もあると思い、免疫向上・雑菌の増殖抑制のあるという、乳酸菌,メシマコブなどのサプリメントを今は毎日ご飯に混ぜて与えています。(効果が有るか定かでは無いですが・・・)
昨日くらいからころんに発情がはじまり血統を残すため最後の交配を考えていますが、また同じようになるのではないかと不安でなりません。
今はかかりつけを違う病院に変わりましたが、これといった処置がないとのことで子宮内に雑菌がいると仮定して、今の時期に子宮洗浄などをしても受胎への影響はないのでしょうか？
また、他に飲み薬などの対処方はないのでしょうか？
お忙しいとは思いますが回答宜しくお願いします。