大腸炎の完治前の吐き気

アドバイス頂きたいと思い、質問させていただきます。
多頭飼いのスコッチテリアがほとんど時期を同じくして軟便になり、
そして粘液、粘膜と多少の血が混じった軟便をしました。
かかりつけ医で「大腸炎」との診断で注射(４日ぐらい連続で)をし、
２日の断食・断水の後、少量の治療食から食事を与えました。
お薬(多分下痢止め)も飲ませています。
それぞれが多少良くなったり戻ったりをし、
また注射をしたり、１日の断食・断水したりして、
約２０日ぐらいで落ち着いてきました。
始めは良くなってきた時に治療食に通常の手作りご飯を混ぜていましたが、
どうもこれを食べさせると軟便、粘膜便に戻ってしまうので、
今は治療食だけにして、水も湯冷ましを２時間に１００ccにしています。
食事の量は、必要量の３分の１から始めて少しずつ増やし、
今は４分の３ぐらいです。お薬は飲ませ続けています。
５歳メスの子は、便は硬くなりましたが、食べる量が少ないからなのか少ししかしませんし、毎日は出ません(毎日出る仔もいます)。
順調に回復していると思っていましたが、昨日から食後２時間くらいたった時に、少量のフードと水を吐き戻します。実際に戻すのは１回か２回ですが、２０分ぐらいしゃっくりをしているような(しゃっくりではありません)感じで吐き気がしてるようで、少し苦しそうです。
その後は落ち着いてぶりかえすことはありません。
それ以外は、いつもどおりに元気です。
吐く原因はどの様なことが考えられますか？
食後には必ず水を飲んでいます(定量)がこれがいけないのでしょうか
この治療食が合わないのか、便秘になってしまったのかなどと考えてしまいます。
やっとみんな落ち着いてきたのにまた戻ってしまうのかもと心配です。
体力はあるようなのですが・・・。
原因とどの様にしてやったらいいかアドバイスお願いします。