尿のなかに黄色から茶色の膿のようなもの

こんにちは。
愛犬のことで相談させていただきます。不妊手術は受けています。
私の犬は尿結石で膀胱炎になり、1月末から現在（10日前）まで抗生物質をステロイドのプレドニゾロンの投薬により膀胱炎を完治させました。また結石のほうも処方食により今は尿のなかに結晶がない状態となりました。
ところが膣から茶色の液体がでてくるようになり、これは抱っこしたときなどにズボンにつくものでカーペットを汚すような感じで膣から出ていました。
これまで治療してくださった獣医師の方に相談すると膣炎ではないかということでした。
そのため膀胱炎治療で使用した抗生物質の種類をニューキノロン系からペニシリン系に変えました。
10日ほど投薬すると膣からの茶色の液体はでなくなったのですが、その後尿のなかに粘調性の茶色～黄色の分泌物（？）の塊がでてくるようになりました。
いったいどうゆうことなのでしょうか？？
愛犬は不妊手術（卵巣、子宮の全摘出）を受けています。なので考えられる子宮蓄膿症はないと思います。
獣医師の方に言わせると尿結石と膀胱炎によって傷ついた膀胱粘膜がでてきているのではないか、とのことでしたが
どのように考えられるのでしょうか？？
長いですが、よろしくお願いいたします。