頻繁に咳をします

我が家に来てから、三週間過ぎたばかりのM・ダックスの女の子です。
三週間前に二回目のワクチンを済ませ、今日三回目を打ちに行く予定でしたが、昨夜半から異物の絡まったような咳をしだしました。眠ると苦しいようで、なかなか眠ってくれません。獣医さんに診察に行ったところ、ウイルス性のものかどうかは早急に出ないとのことでした。二日前から、知り合いのモルモットを預かっています。ゲージもサークルと離してあるのですが、原因の一因かもとのことでした。アレルギーを抑える抗生剤をいただいて帰りましたが、朝よりも咳がひどくなっている気がします。レントゲンや聴診では肺炎ではないということなのですが・・・。仕事をしているので、日中は一人で留守番をさせることが多く、残業などのときは12時間くらい一人です。今日は休みを取りましたが、このような状態でお留守番は大丈夫でしょうか？マンションなので部屋はそれほど暑くはならないのですが、いつもは設定を29度にしてエアコンをかけて出かけています。よろしくお願いいたします。