初めてなので教えてください。

初めて質問させていただきます。チワワ(３ヶ月、男の子)を先月から飼い始めました。
２月２０日生まれなのですが１回目のワクチンはブリーダーさんのところで４月２２日に６種を接種してもらいました。２回目は５月１９日に病院につれていき９種を勧められ、接種したのですが、その際の検便で、
「らせん菌っていう軟便になりやすい菌がいますね～、これがいるときはワクチン打つにはちょっと都合よくないんですよね」
と獣医さんに言われ、
『じゃあ薬で治療して、ワクチンはまた次回ってことなのかな…？』と思いました。それなのに、その獣医さんは注射器を出して、ワクチンを打ったのです。最初薬をだしてきたときは、らせん菌の薬だと思っていました。
軟便や下痢などの症状はまったくなく、健康体だと思っていましたが、初めてのことでわからず、よくわからないまま終わった、という感じでした。らせん菌の薬は後で飲み薬５日分出されました。
３回目は６月９日以降にきてください。と言われ、こちらの質問でもワクチンの接種回数は個体差があるんだ…と知ったのですが、変なところでワクチン接種はしたくないし、知り合いでチワワを飼っている方からは、３回目のワクチンもらせん菌の薬もお金目的なんじゃない？といわれ、不安になっています。
５日間薬も飲ませましたが、何の症状も変わらずです。経過を報告しにきてくださいとも言われませんでした。
初めて犬を飼っているので、獣医さんの対応や病気、ワクチンなどに対して、普通はどうなのかがわからず、神経質になりすぎているのかもしれませんが、ほかの獣医さんのご意見が聞ければと思って質問しました。
らせん菌がいても、ワクチンを打つのは通常ですか？
うちの子の場合は３回目のワクチン接種は必要でしょうか？
長文、下手な文章ですみません。宜しくお願いします。