猫ウイルス性鼻気管炎について

猫ウイルス性鼻気管炎の治療について教えてください。
生後３～４カ月程の捨て猫を飼い始めました。
拾った時にくしゃみと目やにがあったため診ていただいたところ、猫ウイルス性鼻気管炎と診断され、インターフェロンと抗生剤を７日分処方され、鼻については症状が残るかも知れないと言われました。
７日間の投薬で眼やには綺麗になりましたが、鼻水についてはまだ少しありました。風邪の治療を初めて２日後に下痢になったため、相談したところ、菌がいるとので、便を持ってくるようにと言われ、診ていただきました。いろんな種類の菌がいるのが原因とのことで、粉薬を処方され、風邪薬と並行して飲ませるようにとの指示でした。
しかし、この粉薬がとても苦く、また私の技術のなさもあり、飲ませようとしても蟹のように泡を吹いて出してしまい、うまく飲ませることができませんでした。
一週間たち、猫を連れて病院に連れていったところ、それでは粉薬はほとんど飲んでいないので錠剤に変えましょうとのことで、三種類の薬と、食事も指定されたヒルズの猫缶Ｗ／Ｄだけを与えるように言われました。
拾ってきてから、駆虫薬、インターフェロン、抗生物質、そして菌を殺す薬？下痢止め？と小さな子猫にこんなに立て続けに薬を飲ませても大丈夫なのかと心配になり、下痢に対する錠剤はすぐ飲ませずに少し様子を見てみることにしました。
すると、風邪薬を飲まなくなってから２，３日で下痢は止まりました。
ただ菌に対する薬はまだ飲ませていないので、多少軟便ではあるものの、以前のような泥状便ではありません。
しかし、風邪薬と止めてから一週間位してもまだくしゃみが停まっておらず、ここ２日程は餌を食べるときに、ときどきブスブスと鼻が詰まってるような音がします。
風邪に関しては最初に７日分の薬を処方された後は何もいわれておりませんが、このままにしておいてよいものでしょうか？
担当医は初めに、鼻の症状は残るかも知れないと言われているため、これで治療は終了と思われている気がしますが、この病気はしっかり治さないと築脳症になるという情報も見ました。
もう一度治療をしてもらった方がよいでしょうか？
因みに、白血病、エイズは陰性でした。
くしゃみ以外はとても元気で、ご飯もよく食べます。
体重も、拾ってきたときは１．６キロでしたが、一週間後には２キロになっていました。
あと、抗生物質が合わないとしたらその薬品名を知っておいた方がいいと思うのですが、飲み始めて２日ばかりで下痢にはならない、薬ではなく菌が原因だとおっしゃっているので、今になって薬の名前は聞きづらくて聞けません。（因みに、風邪薬を飲む前はいたって普通の便をしていました。）
水薬でクリーム色、白い粉が下の方に沈殿する薬で、口から飲む薬でしたが、もし薬品名がおわかりになるようでしたら教えていただけたら幸いです。