下痢

3歳をもうすぐ迎えるトイプードルです。オスとメスの双子で飼っています。
大変長くなりますが、お許しください。

主にオスの方ですが、今年の初めから下痢に悩んでいます。かかりつけ医と緊急の医師にも見て頂き、ストレスで腸内細菌のバランスが崩れているようだ…と。

たしかにトリミングや病院での健康診断後、旅行の後、また、かまってやるのが少ない時の後に下痢が多いです。
双子のメスも少し後で下痢をすることから、ジアルジアも疑い投薬。ただこれは嘔吐につながり中断しました。

以前はお薬を頂き数日で良くなっていましたが、今はその頃許可を頂いたディアバスターとビオイムバスターを家で飲ますだけです(通院のストレスも除きたいので)。
けれどここ2ヶ月ほどは治りが悪く不安になりご相談することにしました。

健康な時は朝に２度硬めの排便ですが、下痢の時は夜中に泥状便とか水様便。ですが、朝起きるとほぼ良い便。また次の日は良い便。なのにその夜中は泥状といったサイクル。日中は全くしません。

痛がる様子は無し。嘔吐も無し。
食欲、元気は全く普通。
体重減少も無し。

アレルギーを疑ったりもしましたが、皮膚症状は全く無し。
フードに関してはチキンですが、ローテーションのためにラムやビーフを食べさせると下痢をしたため、チキンに戻すと治り、以後チキンのみです。
オヤツなどもパピーの頃から続けているものを少しだけ。

何をどうお聞きしてよいのかわからない状態ですが、
①こんな症状でもアレルギーの可能性はあるのか。
②何か原因として他に考えられることはあるのか。
③また、ストレスを全く無しにする生活は不可能なので、いくら元気にしているといっても、これからずっとこんな状態で身体への負担はどうなのか。

を、主にお聞きしたいです。
どうぞよろしくお願いいたします。