前足に脱毛跡があります。

御世話になります。
黒ラブ生後5ヶ月です。
約1ヶ月前から右前足に100円玉くらいの大きさで毛が薄くなっていることに気づいていましたが、特に痒がる様子もないので様子をみていました。
5/13狂犬病接種のために掛かりつけの病院へ行き、足の毛をついでに観ていただいたら、毛穴にダニがいると・・。皮膚炎を起こしているので、抵抗力の弱い幼犬は今のうちにしっかり治療しないといけないと。
病院が大嫌いになるほどの皮下注射を2週間おきに接種しに来て下さいと言われ、さっそく接種すると診察台から下ろすや、床に体を擦りつけながらクンクン泣き痛そうにしていました。
床に這いずりまわるほど痛い注射での治療法しかないのでしょうか？
先生曰く、その注射を打っている間はフィラリア対策はしなくてもいいとのことでしたが。
次回、2回目の病院は5/27の予定ですが、あの痛みをまたさせてしまうのかと思うと可哀想でなりません。
よろしくお願い致します。