尿結石で与える抗生剤について

この度は、うちの猫（♂）８才位のことでご意見を頂きたく質問いたしました。
元が迷い猫だったことや家の中であっちこっちにスプレー（去勢済）するのでトイレに行きたいと鳴いたら外にだすようにしています。しかし外から帰ってきてまたすぐ行きたいと鳴く頻度が多いこと、滅多にしない家の猫トイレで尿をしようとかがんでいること等から病院で診察したところ、尿結石（石にはなっていない状態）で現在薬・食事での療養を行っています。

食事はウォルサムのＰＨコントロール、薬は日に抗生剤を２回・止血剤を１回です。
薬を与え出してもう１ヶ月ちょいになります。なかなか症状が回復せず（悪くはならないのですが）先生は良くなって悪くなっての波があるのでとにかく薬を続けていきましょう。とおっしゃっています。

先生の根気よく薬を・・・とはいったいどれくないの目安なのでしょうか？私自身毎日抗生剤を与え続けるのは仕方がないとはいえあまりいい気がしないのです。
できればもっと身体に抵抗のない形で治療をしてあげたい。そう思ってしまいます。

ワガママかもしれませんが何か方法があるかも。と思い投稿させて頂きました。
ちなみに水はよく飲みます。食事の後、外から帰ってきてから、量も見ている限りは結構飲んでいるように思います。

よろしくお願い致します。