肛門や陰部の炎症や痒みの原因や適切な薬を教えて下さい。

どうしたら良いのかわからずご相談申し上げます。
シェルティー、12歳メスです。
長くなりますが今までの経緯をお話し致します。
6歳頃突然身体中に黒い斑点が出来て毛も抜け始めました。
慌てて病院に行った所、真菌があるという事でセファレキシンを処方されました。その後、身体のあちこちが肥厚しベタついたカサベタや大きなフケの固まりが沢山できました。半年以上経過しても改善されず担当医師が変わりました。
いろいろ検査した結果、甲状腺低下症が判明し、チラージンの処方、そしてシャンプーはノルバサンに、ご飯はロイヤルカナンの消化器系サポートへ変更となりました。その結果、お陰様でチラージンを飲みはじめてからは、黒い斑点も消え、毛も生え始めました。そしてその間、抗菌薬はオーグメンチンに変わり(この頃の検査では酵母菌が検出されていました)、至る所にできるベタついたカサベタやフケフケの箇所も始めの頃に比べれば少しずつ減り良くなっていきました。
しかし、こちらが治ってもまた別の所に出来るという常にスッキリしない状態が4年半位続いた頃、大腸菌も検出されたということでホスホマイシン(500mg2/3錠を1日２回)に変更となりました。その後1年間位は、一旦は完治するけど、暫くすると再発するろいう状態まで改善されました。
11歳になったころは、背中以外は再発しなくなりましたが、今までも時々見られた陰部やお尻が赤くなって痒がるという症状が、ホスホマイシンだけでは治らなくなってきて、プレドニロゾン5mg(1日1錠を1週間、その後1日おきに1週間服薬)を追加されると赤みが引くという状態です。

しかし出来るだけステロイドは飲ませたくありませんし、そして前々からもしかしたら皮膚病はマラセチアではないのか、またお尻が炎症するのも酵母菌も含めて真菌(家人に水虫持ちがいるので)が悪さをしているのではないかという懸念が拭いきれず、遅まきながら素人なりに調べた所、益々その思いが強くなりました。
その場合、抗生物質ではなく、抗真菌薬や抗真菌薬のシャンプー、塗り薬の投与になるそうですね。ただ抗真菌薬の投与も飲み合わせや期間に慎重を要するようなので、今の所内臓の健康状態は問題無いのですがチラージンを飲んでいるうちの子には合わないと考えられたのでしょうか？
でも飲み合わせ的にはあまり問題無いような？、、
確かに大腸菌が出た時点で更に効くホスホマイシンに切り替えられたのは何となく分かるような気もしますが 、でもその前から真菌や酵母菌が検出されており、皮膚も明らかにマラセチアの状態を呈していた(今回調べてみて確信しざるをえません)にもかかわらず、先生は「皮膚病には、まずセファレキシン、その次にオーグメンチン、大抵の犬はそれで治るけど効かないようだからホスホマイシンに」と言われ、ずーっと抗生物質だけ出され、今まで一言もマラセチアかもと言われないのが、益々不思議に思えてくるのです、、、
素人判断の勝手の思い込みでしょうか？

次回、またお尻が炎症した時には再度菌の検査をしてもらい、結果次第では抗真菌薬の処方についてもお願いしたいと思いますが(また大腸菌も検出された場合にはホスホマイシンと抗真菌薬の併用が出来るのかも良くわかりませんが。その上とても勇気が要りますが)如何なものでしょうか？
先生のご判断を頂きたく長々と書いてしまいました。
どうかよろしくお願い致します。