夜間の吠え

夜間の吠えについて、対処方法がわかりません。
夫婦共働きで平日3、4日程度は朝8時〜18時頃まで留守番
この間の留守番は出来ており、寝ているようです。
土日は私がだいたいいます。
日中出かける時は、ワンツーの掛け声でトイレをすませ、おやつを見せハウスと言えば自分からケージに入って行きます。その後はおとなしくしています。

休日は日中多少ウトウトしていても、散歩や部屋の中で遊んでいる事が多く、吠える事もなく割と穏やかに感じます。
ただ、夕方頃からソワソワし始め、テレビや外の音に過敏に反応し吠え始め、夜ケージに入れると寝る事なく吠え続け、遠吠えまでする事もあります。そのままにしておくと、とにかくずっと吠え続け止みません。
ケージ、クレートはリビングにあり夫婦別階の部屋で就寝しています。
今まで色々試してみましたが、一緒に寝るとこちらが寝返りを打つと唸って噛み付いてくる、クレート、簡易ケージに入れ同じ部屋で寝ると明け方にキュンキュン鳴き出し、出せと扉をがちゃがちゃしだす。近くに来たがる、でも一緒に寝ると噛まれる、と言った様子で同室は無理です。
一時期夜間ケージで吠えてはいましたがなんとか、その後収まっていたのが、急に酷く吠えるようになり、今はリビングでクレートに入れています。（主人がその方が多少静かだから、との事）
今晩もクレートに入れても酷く吠えるので（遠吠えまでしていました）、暫く私がクレートの隣で横になり様子を見ていましたが、鼻鳴きと泣いているかのような声で鳴き、扉をがちゃがちゃしていました。暫くそのままにしてそっと自室に戻った後は吠えてはいません。今日はこれで収まりましたが、この対処方法で良いのでしょうか？

トレーナーさんに相談をしてもなかなか改善されず、どうしたら良いのかわかりません。
スワレ、フセ、マテのトレーニングはしています。
散歩も朝は軽めですが、夜は公園でボール遊びで本気で走らせる等して疲れるほど走らせています。
ご飯もケージ内、おやつやおもちゃを上げるときもハウスをさせる等しています。
人がいる時にあまりケージにいさせる事はあまりありません。（出せと吠える、暴れる。特に主人がいる時に酷い気がします。私と主人がいる時はずっと主人にくっついています。違う部屋に主人が行くと付いていく、階が違う時は階段でずっと待っているが、私が部屋を離れると様子は見に来るがすぐ定位置に戻る、若しくは様子も見に来ない。待ってる事はほぼない。）

また、今は落ち着きましたが、子供の頃は人の姿が見えなくなると火がついたように吠えていました。しつけ書には、反応してはいけないとありますが、そのままでいると全く吠え止まずこちらが精神的に参ってしまう位でした。

またケージ内にはトイレは置いていません（ケージが広くなると吠えが酷くなる、ケージで使っているベッド以外を入れると警戒してしまう。クレートもケージ内では不可ですが、ケージ外で入るのはできる。ネンネと命令をすると自分で入れる。）

毎晩彼女もストレスでしょうし、私達も疲れてしまいます。
どう対処して行くべきなのでしょうか。