お腹の中の赤ちゃんについて

はじめまして。心配な事があり、質問をさせて頂きます。
１歳７カ月のトイプードルです。４月１５日に交配をして、通常の体重が３．６キロぐらいですが、４．７キロに増え、お乳も目立つように大きくなってきましたので、、本日交配から４２日目で動物病院で診察をして頂きました。最初　聴診器で心音が聞き取りづらいとのことで、レントゲンを撮りましたが、画質を調整しても骨などがはっきりとは見えませんでした。そこで超音波検査をしたところ、手足はまだないが、心臓と思われる物が最低でも３つあるとのことでした。ただ大きさが１，５センチ～２センチぐらいしかなく、小さすぎると言われました。もともとドライフードをほとんど食べない犬なのでこの時期は何とか食べさせなくてはと総合栄養食の缶詰めを与えていますが、必要量にはほど遠い量しか食べてくれません。食事を取らないのがいけないのでしょうか？交配した相手の雄犬が従兄弟になるので奇形などということも考えられますか？
お手数をおかけいたしますが、どうぞよろしくお願いいたします。